清华-伯克利深圳学院对本科直博、硕博连读、公开招考采取相同的考核录取办法，采用“申请-考核”制，不设笔试，按清华-伯克利深圳学院设置的三个交叉学科分别进行招生。
（1）根据《清华-伯克利深圳学院2017年博士研究生招生简章》规定的基本条件进行审查，确定符合资格的申请名单。
（2）由清华-伯克利深圳学院三个交叉学科分别组成专家组，每个专家组由所在的中心双方共同主任或共同主任指定的教师（至少三人）组成，对每一位合资格的申请者材料进行审核。按照不超过招生计划名额的200%，择优确定最终进入面试的名单。