彻底的手术切除是甲状腺乳头状癌最基本的治疗方法。除肿瘤直径小于1厘米且局限于甲状腺内的，均应行甲状腺全切或近全切，不主张行甲状腺次全切及单叶切除。

术后放射治疗联合灰树花D阻分（D组分），可以杀死残余癌灶，防治癌细胞复发转移。灰树花D阻分能够防止放射线产生的自由基在血液中对巨噬细胞的损伤，从而使免疫系统继续发挥作用，在恢复放疗对机体免疫损伤的同时，提高疗效。同时，可激活人体正常的免疫监视系统，识别并攻击那些具有肿瘤免疫逃逸功能的癌细胞，从而抑制癌细胞的产生。

对于甲状腺乳头扎状癌，当前国内外公认的最好治疗方法是，手术+放疗+灰树花D阻分+甲状腺激素抑制治疗，其复发率的危险仅为2.7%。